第五百五十一章 左良玉怂了
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锦衣卫中军大帐里，牛成熊、花铁干、管得宽、蔡大山、田小军、吴飞、净明、楚昭南、温小四、乔拼、游正普等将领齐聚，水军副将覃衍火也风风火火赶到了，要知道水军烧毁了左良玉部七千多只战船，武昌城一整夜都是通红的，而覃衍火也是一夜未眠两眼通红，田承嗣让亲兵给覃衍火搬来一把靠背椅，覃衍火婉拒了这个特殊待遇。
田承嗣说道：“昨日秦副将火烧左营水军，为我锦衣卫立下了大功。”
覃衍火说道：“是大人指挥得好，是将士们英勇，末将不敢居功。”
田承嗣哈哈一笑道：“秦副将，功劳该你的，你推也推不掉的，昨日锦衣卫大败左营三十万兵马，帐中将领人人都有功，不过这嘉奖的事情先放一放，本官有事情要说。”
顿时整个中军大帐是鸦雀无声，田承嗣把朱媺娖的十万明军兵败禹州之事说了，中军大帐一下子炸开了锅，锦衣卫众将领都议论纷纷，对朱媺娖率领十万明军轻易败给闯军刘芳亮的十万兵马非常惋惜，要是让田大人统领这十万明军，说不定把李自成的襄京（襄阳府）都打下来了。
田承嗣说道：“好了，我们谈大家武昌城的事情。”
牛成熊说道：“大人，请给锦衣卫三天时间的准备，咱老牛同兄弟们一定拿下武昌城。”
田承嗣本来是准备攻打武昌城的，现在朱媺娖惨败于闯军，而这个大败明军的闯军将领刘芳亮，正是自己当日在皇上面前力保的俘虏，天知道皇上和长公主会这样收拾自己，自己再留在武昌跟左良玉死磕，这显然不是一件明智的事情。
田承嗣沉吟不语，管得宽明白田承嗣的意思，说道：“大人，我们锦衣卫不过是要惩罚一下左良玉部，现在效果已经达到了，不如让左良玉把抢自锦衣卫的财物人口送还，这样能免去了锦衣卫攻打武昌城的伤亡。”
管得宽的话一出口，锦衣卫将领们就明白了田承嗣的心思，纷纷表示用俘虏换回锦衣卫的财物人口最好，田承嗣让蒋尚武去喊话，给左良玉一天的时间答复，用抢自锦衣卫的财物和人口换回自己的十四万人马，并让锦衣卫中军后队做好撤退的准备。
众将领们离开中军大帐后，田承嗣又得到河南方面的消息，右威武将军刘汝魁率领两万闯军，与汝宁城闯军余孽里应外合，于十月初九日也袭破汝宁城，明军总兵杨德政衣甲不整从崇王府匆忙出来，被杀到的闯军精骑格杀于崇王府前，总兵方国安率领本部兵马开东门杀出，一路奔南直隶庐州府逃去。
田承嗣得到明军汝宁城兵败的消息，知道这武昌再也呆不下去了，好在只给左良玉一天的时间考虑缴获俘虏，因此不担心耽误回军江南的时间，现在唯一需要考虑的是，如果左良玉拒绝自己的条件，是不是要把那十四万俘虏都斩尽杀绝。
直到傍晚田承嗣也没有得到左良玉的答复，锦衣卫官兵大骂左良玉是缩头乌龟，田承嗣虽然觉得左良玉有些反常，可并没有想到左良玉一直昏迷不醒，既然左良玉装聋作哑，舍不得那一百万金银珠宝、三千辆大车和数千女子，自己不介意做一回屠夫，狠狠的削弱一下这东林党的帮凶。
天黑后田承嗣下达了坑杀俘虏的命令，早就磨刀霍霍的锦衣卫官兵，把绑成一串串的左营俘虏，押到指定的深坑上，一刀下去就把俘虏推进坑里，不少俘虏没有被杀死，或者根本没有被杀到，却连着绳子十几人一起滚进了深沟，一刻钟的功夫，就有两万多俘虏被杀落深沟里，深沟传来凄厉绝望的哭喊声，时隐时现的火光看得见深沟里有许多俘虏在蠕动，锦衣卫官兵在不断地杀俘虏，足足杀到快五更天才完事。。。然后两万多锦衣卫官兵用土把杀俘虏的深坑深深的覆盖，到了中午时分沙土下不断有声音传出，覆盖的沙土时不时的蠕动着。
下午的时候，左良玉派来一个胡姓参将求见，表示愿意用一百万金银财宝和一万女子换回锦衣卫手里的十四万俘虏，田承嗣这才知道前日左良玉气晕了，昨日还没有醒过来，武昌城里无人敢做主，这使得双方错失了谈判机会，至于左良玉愿意多拿五千女子来交换，是拿三千车财物已经被手下瓜分了，就是还给锦衣卫也还不了了。
田承嗣又好气又好笑，上天给自己和左良玉开了一个大玩笑，不过自己也从胡参将嘴里得知左良玉的情况，看这个样子左良玉恐怕挨不到福王监国之时了，于是恐吓胡参将道：“那十四万俘虏因为你们左营拒不答复本官的条件，已经被锦衣卫全部处死了。”
胡参将“啊”的一声，惊得一屁股坐到了地上，嘴里念念有词“啊，怎么会这样。。。”
田承嗣说道：“胡将军，回去告诉左良玉，改日本官跟他在黄鹤楼面谈吧。”
两亲兵去扶地上的胡参将，胡参将吓得直哆嗦，亲兵说道：“胡将军，请随我等出帐吧。”
胡参将这才意识到自己太失态了，于是尽力克制住对田承嗣的恐惧说道：“田大人，左大帅说了，两虎相争必有一伤，左营与锦衣卫同室*戈，只能朝廷受到损失，让闯贼、献贼在一旁看笑话，请田大人暂息刀兵。”
田承嗣哈哈大笑道：“左良玉心里还有朝廷，这话胡将军你信吗？”
胡参将迟疑了一下说道：“大人，我信的。”
田承嗣说道：“好，好一个我信的，要本官暂息刀兵，锦衣卫死伤弟兄们可不会答应的。”
胡参将说道：“大人，末将奉大帅之命请和，没想到事情到了这个地步，请大人开一个条件，末将好回去向左大帅复命。”
田承嗣沉吟了一会说道：“这样吧，金银珠宝和抓去的男女放回来，并严惩杀害我锦衣卫官兵的首恶，本官就网开一面不攻打武昌城，不然打破武昌城玉石俱焚。”
胡参将听了欲言又止，最后只说道：“大人，末将这就回去向大帅禀告。”
胡参将离开中军大帐后，田承嗣忍不住哈哈大笑，原来左良玉这龟孙撑不住了，管得宽进言道：“大人，看来武昌城里比我们想象中还要糟糕，干脆把武昌城拿下算了。”
田承嗣摇摇头说道：“小管，虽然左良玉损失了二十多万兵马，可他的前五营并没有受到什么损失，我们锦衣卫仅有五万多人，攻打武昌城里数十万左营兵马，这不是一件划算的买卖呀。”
田承嗣虽然想灭了左良玉，可并不愿意攻打武昌城这样的坚城，毕竟自己的五万多锦衣卫官兵，七成以上都是新兵，经过这次攻打闯军的系列战斗，这些新兵逐渐走向成熟，明年就是甲申年，这一年将是大明风起云涌最关键的一年，手里掌握一支强大的军队，才会在甲申之变中也有主动权，因此田承嗣可不想把手里的官兵白白浪费在武昌城下。
田承嗣传令锦衣卫做出进攻武昌城的姿态，静等着左良玉上当受骗，十五日一大早，胡参将来到锦衣卫，见到田承嗣后说道：“大人，大帅答应把金银珠宝和俘获的男女送回，只是是罪魁祸首已经死在前日的战斗中了，请大人就不要再追究了。”
说起罪魁祸首应该是左良玉的儿子左梦庚，不过要左良玉交出他儿子，这是不可能的事情，田承嗣说道：“好吧，交出金银财宝和俘获的男女，本官就撤围而去。”
胡参将见事情就这样成了，脸上忍不住露出欣喜之色，要知道在左营里，最值钱是粮食，而不是什么金银珠宝，至于女人左营更多了，正嫌人多了没法养，送给锦衣卫等于松了包袱，只是对锦衣卫低头认栽，左大帅的面子丢大了，不过这年头谁的拳头大谁就是大爷，左良玉不想死就顾不得自己这面子了。
当天下午按约定，锦衣卫退出武昌中和门十里之外，由被俘的近百名锦衣卫官兵坐大车，护着一百万金银珠宝出城，随后是被俘的男女，队伍走了大约半个时辰，足足出来一万五千多人，紧接着左营官兵关闭了中和门城门。
锦衣卫接收到一百万金银珠宝和一万名女子和五千男子，这些男女多数跟随军的亲人相认，就是没有亲人也有熟人，不能相认的男子有三四百人，被锦衣卫拉到一处大营严加审问，至于女子不能相认的多达五千多人，这些女人都数是左营不要的，不是长得丑陋就是年龄偏大，不少女人还拖儿带崽的。
田承嗣见了不由得苦笑，左良玉把锦衣卫当救济院了，也罢，救人一命胜造七级浮屠，把这些女人送到江南去，算是给了她们一条生路，考虑到这些女人不善远行，田承嗣吩咐把这些女人送到战船上去。
十月十六日，锦衣卫水陆两路东下，这是武昌城外的岸边还冒着一股股的青烟，看见左良玉的水师损失有多大，在左良玉有生之年里，再也不可能建立一支强大的水师与江南对抗，左良玉部只能是大明朝最多军阀中的一股。
十月二十三日锦衣卫抵达九江城，田承嗣欲在九江城作短暂休整，江西、湖广、应天、安庆总督吕大器闭城门不纳，锦衣卫官兵群情汹涌，向田承嗣请命要攻进九江城，找吕大器讨一个说法。
吕大器，字俨若，号先自，四川遂宁县北坝人，明神宗万历十四年生，崇祯元年中进士，授行人，历吏部稽勋主事、右佥都御史、南京兵部右侍郎，为官清廉，嫉恶如仇，节气甚高，在民众中极有威望，与黄宗羲、史可法、钱谦益、瞿式耜、龚鼎孳等相交甚笃，是明末东林党中很有声望的人；曾巡抚甘肃，败柴时华等，又曾总督保定、山东、河北、江西、湖广、应天、安庆军务，还曾讨张献忠破樟树镇，收复峡江、永新二郡。
崇祯十年，吕大器告假居家，见邑城低矮且有毁损，倡议修筑，刚竣工，张献忠部分兵袭攻遂宁，吕大器佐县令任宾臣抵御，自捐金钱，募兵四百，又逢甘肃道旷昭护家眷归，有边兵二千名参与，协同城内士民一意扼守，城未破，受到崇祯奖赏，不久出任关南道参议，又迁固原副使。
崇祯十四年升任右佥都御使巡抚甘肃，吕大器揭发总兵柴时华不法行为，柴时华被撤职，派副将王世宠代柴时华，柴时华竟向西部及吐鲁番乞兵为乱，吕大器令王世宠征讨，柴时华战败*死，此时塞外尔迭尼、黄台吉等拥兵以乞赏为名企图进犯肃州，吕大器借犒赏名义，投毒于饮马泉，杀其部卒无数；又遣总兵马火广督副将王世宠等，攻讨塞外为首作乱者，斩七百余人，抚二十八族，击败其余党，至此西部边地基本平定。
崇祯十五年六月，大器升任兵部右侍郎，至次年三月才就任，崇祯皇帝诏令大器以本官兼右佥都御史，总督保定、山东、河北军务，这时李自成大顺军已开始了大规模歼灭明军的战斗，明王朝岌岌可危，吕大器及诸将驰援扼守顺义牛栏山，总督赵光扌卞集合诸镇军队大战清军于螺山，结果明军大败，只有吕大器所部损失最小。
崇祯十六年五月，保定地区解除戒严后，吕大器出任江西、湖广、应天、安庆特设总督，督所驻九江，此时湖北地失，武昌城陷，左良玉驻军九江称病不进，疑吕大器有兼并自己的意图，而与吕大器不和，吕大器觉知后，乃亲到良玉床前慰劳，使其疑心消解，这时，张献忠部进兵湖南，陷袁州、吉安，吕大器遣部将与左良玉军破献忠于樟树镇，复占峡江、永新二郡。
崇祯十七年，李自成攻破北京，崇祯上吊死后，南京大臣议立国君，吕大器与钱谦益、雷纟寅祚等主张拥立潞王朱常芳，议未定，而马士英与江北四镇拥福王朱由崧至，是为弘光帝，弘光帝立，迁大器吏部左侍郎，吕大器受排挤益急，上表揭发马士英弄权误国之行迹，弘光帝以”和衷体国”答之，不久刘泽清入朝，马士英阴令其劾奏大器、雷纟寅祚心怀异图，迫使吕大器乞休离位，吕大器乃写就监国告庙文书送交内阁，以表明自己毫无他图的心迹，马士英怀忿不已，又阴令太常卿李沾攻击大器，弘光帝怒遂撤大器一切职务，又命令法司逮办，当时因蜀地尽失而未执行。
弘光元年，明宗室唐王朱聿键在福州即位，是为隆武帝，召吕大器为兵部尚书兼东阁大学士，次年隆武帝汀州失守被掳绝食而死，吕大器奔广东与丁魁楚等拥立永明王监国，永明王乃令吕大器以原官兼掌兵部事，之后进少傅，尽督西南诸军，吕大器鞠躬尽瘁尽忠南明，顺治六年，吕大器病逝于贵州都匀，谥“文肃”，归葬四川遂宁磨溪，后迁葬遂宁城北嘉禾桥。
锦衣卫中军大帐里，牛成熊、花铁干、管得宽、蔡大山、田小军、吴飞、净明、楚昭南、温小四、乔拼、游正普等将领齐聚，水军副将覃衍火也风风火火赶到了，要知道水军烧毁了左良玉部七千多只战船，武昌城一整夜都是通红的，而覃衍火也是一夜未眠两眼通红，田承嗣让亲兵给覃衍火搬来一把靠背椅，覃衍火婉拒了这个特殊待遇。
田承嗣说道：“昨日秦副将火烧左营水军，为我锦衣卫立下了大功。”
覃衍火说道：“是大人指挥得好，是将士们英勇，末将不敢居功。”
田承嗣哈哈一笑道：“秦副将，功劳该你的，你推也推不掉的，昨日锦衣卫大败左营三十万兵马，帐中将领人人都有功，不过这嘉奖的事情先放一放，本官有事情要说。”
顿时整个中军大帐是鸦雀无声，田承嗣把朱媺娖的十万明军兵败禹州之事说了，中军大帐一下子炸开了锅，锦衣卫众将领都议论纷纷，对朱媺娖率领十万明军轻易败给闯军刘芳亮的十万兵马非常惋惜，要是让田大人统领这十万明军，说不定把李自成的襄京（襄阳府）都打下来了。
田承嗣说道：“好了，我们谈大家武昌城的事情。”
牛成熊说道：“大人，请给锦衣卫三天时间的准备，咱老牛同兄弟们一定拿下武昌城。”
田承嗣本来是准备攻打武昌城的，现在朱媺娖惨败于闯军，而这个大败明军的闯军将领刘芳亮，正是自己当日在皇上面前力保的俘虏，天知道皇上和长公主会这样收拾自己，自己再留在武昌跟左良玉死磕，这显然不是一件明智的事情。
田承嗣沉吟不语，管得宽明白田承嗣的意思，说道：“大人，我们锦衣卫不过是要惩罚一下左良玉部，现在效果已经达到了，不如让左良玉把抢自锦衣卫的财物人口送还，这样能免去了锦衣卫攻打武昌城的伤亡。”
管得宽的话一出口，锦衣卫将领们就明白了田承嗣的心思，纷纷表示用俘虏换回锦衣卫的财物人口最好，田承嗣让蒋尚武去喊话，给左良玉一天的时间答复，用抢自锦衣卫的财物和人口换回自己的十四万人马，并让锦衣卫中军后队做好撤退的准备。
众将领们离开中军大帐后，田承嗣又得到河南方面的消息，右威武将军刘汝魁率领两万闯军，与汝宁城闯军余孽里应外合，于十月初九日也袭破汝宁城，明军总兵杨德政衣甲不整从崇王府匆忙出来，被杀到的闯军精骑格杀于崇王府前，总兵方国安率领本部兵马开东门杀出，一路奔南直隶庐州府逃去。
田承嗣得到明军汝宁城兵败的消息，知道这武昌再也呆不下去了，好在只给左良玉一天的时间考虑缴获俘虏，因此不担心耽误回军江南的时间，现在唯一需要考虑的是，如果左良玉拒绝自己的条件，是不是要把那十四万俘虏都斩尽杀绝。
直到傍晚田承嗣也没有得到左良玉的答复，锦衣卫官兵大骂左良玉是缩头乌龟，田承嗣虽然觉得左良玉有些反常，可并没有想到左良玉一直昏迷不醒，既然左良玉装聋作哑，舍不得那一百万金银珠宝、三千辆大车和数千女子，自己不介意做一回屠夫，狠狠的削弱一下这东林党的帮凶。
天黑后田承嗣下达了坑杀俘虏的命令，早就磨刀霍霍的锦衣卫官兵，把绑成一串串的左营俘虏，押到指定的深坑上，一刀下去就把俘虏推进坑里，不少俘虏没有被杀死，或者根本没有被杀到，却连着绳子十几人一起滚进了深沟，一刻钟的功夫，就有两万多俘虏被杀落深沟里，深沟传来凄厉绝望的哭喊声，时隐时现的火光看得见深沟里有许多俘虏在蠕动，锦衣卫官兵在不断地杀俘虏，足足杀到快五更天才完事。。。然后两万多锦衣卫官兵用土把杀俘虏的深坑深深的覆盖，到了中午时分沙土下不断有声音传出，覆盖的沙土时不时的蠕动着。
下午的时候，左良玉派来一个胡姓参将求见，表示愿意用一百万金银财宝和一万女子换回锦衣卫手里的十四万俘虏，田承嗣这才知道前日左良玉气晕了，昨日还没有醒过来，武昌城里无人敢做主，这使得双方错失了谈判机会，至于左良玉愿意多拿五千女子来交换，是拿三千车财物已经被手下瓜分了，就是还给锦衣卫也还不了了。
田承嗣又好气又好笑，上天给自己和左良玉开了一个大玩笑，不过自己也从胡参将嘴里得知左良玉的情况，看这个样子左良玉恐怕挨不到福王监国之时了，于是恐吓胡参将道：“那十四万俘虏因为你们左营拒不答复本官的条件，已经被锦衣卫全部处死了。”
胡参将“啊”的一声，惊得一屁股坐到了地上，嘴里念念有词“啊，怎么会这样。。。”
田承嗣说道：“胡将军，回去告诉左良玉，改日本官跟他在黄鹤楼面谈吧。”
两亲兵去扶地上的胡参将，胡参将吓得直哆嗦，亲兵说道：“胡将军，请随我等出帐吧。”
胡参将这才意识到自己太失态了，于是尽力克制住对田承嗣的恐惧说道：“田大人，左大帅说了，两虎相争必有一伤，左营与锦衣卫同室*戈，只能朝廷受到损失，让闯贼、献贼在一旁看笑话，请田大人暂息刀兵。”
田承嗣哈哈大笑道：“左良玉心里还有朝廷，这话胡将军你信吗？”
胡参将迟疑了一下说道：“大人，我信的。”
田承嗣说道：“好，好一个我信的，要本官暂息刀兵，锦衣卫死伤弟兄们可不会答应的。”
胡参将说道：“大人，末将奉大帅之命请和，没想到事情到了这个地步，请大人开一个条件，末将好回去向左大帅复命。”
田承嗣沉吟了一会说道：“这样吧，金银珠宝和抓去的男女放回来，并严惩杀害我锦衣卫官兵的首恶，本官就网开一面不攻打武昌城，不然打破武昌城玉石俱焚。”
胡参将听了欲言又止，最后只说道：“大人，末将这就回去向大帅禀告。”
胡参将离开中军大帐后，田承嗣忍不住哈哈大笑，原来左良玉这龟孙撑不住了，管得宽进言道：“大人，看来武昌城里比我们想象中还要糟糕，干脆把武昌城拿下算了。”
田承嗣摇摇头说道：“小管，虽然左良玉损失了二十多万兵马，可他的前五营并没有受到什么损失，我们锦衣卫仅有五万多人，攻打武昌城里数十万左营兵马，这不是一件划算的买卖呀。”
田承嗣虽然想灭了左良玉，可并不愿意攻打武昌城这样的坚城，毕竟自己的五万多锦衣卫官兵，七成以上都是新兵，经过这次攻打闯军的系列战斗，这些新兵逐渐走向成熟，明年就是甲申年，这一年将是大明风起云涌最关键的一年，手里掌握一支强大的军队，才会在甲申之变中也有主动权，因此田承嗣可不想把手里的官兵白白浪费在武昌城下。
田承嗣传令锦衣卫做出进攻武昌城的姿态，静等着左良玉上当受骗，十五日一大早，胡参将来到锦衣卫，见到田承嗣后说道：“大人，大帅答应把金银珠宝和俘获的男女送回，只是是罪魁祸首已经死在前日的战斗中了，请大人就不要再追究了。”
说起罪魁祸首应该是左良玉的儿子左梦庚，不过要左良玉交出他儿子，这是不可能的事情，田承嗣说道：“好吧，交出金银财宝和俘获的男女，本官就撤围而去。”
胡参将见事情就这样成了，脸上忍不住露出欣喜之色，要知道在左营里，最值钱是粮食，而不是什么金银珠宝，至于女人左营更多了，正嫌人多了没法养，送给锦衣卫等于松了包袱，只是对锦衣卫低头认栽，左大帅的面子丢大了，不过这年头谁的拳头大谁就是大爷，左良玉不想死就顾不得自己这面子了。
当天下午按约定，锦衣卫退出武昌中和门十里之外，由被俘的近百名锦衣卫官兵坐大车，护着一百万金银珠宝出城，随后是被俘的男女，队伍走了大约半个时辰，足足出来一万五千多人，紧接着左营官兵关闭了中和门城门。
锦衣卫接收到一百万金银珠宝和一万名女子和五千男子，这些男女多数跟随军的亲人相认，就是没有亲人也有熟人，不能相认的男子有三四百人，被锦衣卫拉到一处大营严加审问，至于女子不能相认的多达五千多人，这些女人都数是左营不要的，不是长得丑陋就是年龄偏大，不少女人还拖儿带崽的。
田承嗣见了不由得苦笑，左良玉把锦衣卫当救济院了，也罢，救人一命胜造七级浮屠，把这些女人送到江南去，算是给了她们一条生路，考虑到这些女人不善远行，田承嗣吩咐把这些女人送到战船上去。
十月十六日，锦衣卫水陆两路东下，这是武昌城外的岸边还冒着一股股的青烟，看见左良玉的水师损失有多大，在左良玉有生之年里，再也不可能建立一支强大的水师与江南对抗，左良玉部只能是大明朝最多军阀中的一股。
十月二十三日锦衣卫抵达九江城，田承嗣欲在九江城作短暂休整，江西、湖广、应天、安庆总督吕大器闭城门不纳，锦衣卫官兵群情汹涌，向田承嗣请命要攻进九江城，找吕大器讨一个说法。
吕大器，字俨若，号先自，四川遂宁县北坝人，明神宗万历十四年生，崇祯元年中进士，授行人，历吏部稽勋主事、右佥都御史、南京兵部右侍郎，为官清廉，嫉恶如仇，节气甚高，在民众中极有威望，与黄宗羲、史可法、钱谦益、瞿式耜、龚鼎孳等相交甚笃，是明末东林党中很有声望的人；曾巡抚甘肃，败柴时华等，又曾总督保定、山东、河北、江西、湖广、应天、安庆军务，还曾讨张献忠破樟树镇，收复峡江、永新二郡。
崇祯十年，吕大器告假居家，见邑城低矮且有毁损，倡议修筑，刚竣工，张献忠部分兵袭攻遂宁，吕大器佐县令任宾臣抵御，自捐金钱，募兵四百，又逢甘肃道旷昭护家眷归，有边兵二千名参与，协同城内士民一意扼守，城未破，受到崇祯奖赏，不久出任关南道参议，又迁固原副使。
崇祯十四年升任右佥都御使巡抚甘肃，吕大器揭发总兵柴时华不法行为，柴时华被撤职，派副将王世宠代柴时华，柴时华竟向西部及吐鲁番乞兵为乱，吕大器令王世宠征讨，柴时华战败*死，此时塞外尔迭尼、黄台吉等拥兵以乞赏为名企图进犯肃州，吕大器借犒赏名义，投毒于饮马泉，杀其部卒无数；又遣总兵马火广督副将王世宠等，攻讨塞外为首作乱者，斩七百余人，抚二十八族，击败其余党，至此西部边地基本平定。
崇祯十五年六月，大器升任兵部右侍郎，至次年三月才就任，崇祯皇帝诏令大器以本官兼右佥都御史，总督保定、山东、河北军务，这时李自成大顺军已开始了大规模歼灭明军的战斗，明王朝岌岌可危，吕大器及诸将驰援扼守顺义牛栏山，总督赵光扌卞集合诸镇军队大战清军于螺山，结果明军大败，只有吕大器所部损失最小。
崇祯十六年五月，保定地区解除戒严后，吕大器出任江西、湖广、应天、安庆特设总督，督所驻九江，此时湖北地失，武昌城陷，左良玉驻军九江称病不进，疑吕大器有兼并自己的意图，而与吕大器不和，吕大器觉知后，乃亲到良玉床前慰劳，使其疑心消解，这时，张献忠部进兵湖南，陷袁州、吉安，吕大器遣部将与左良玉军破献忠于樟树镇，复占峡江、永新二郡。
崇祯十七年，李自成攻破北京，崇祯上吊死后，南京大臣议立国君，吕大器与钱谦益、雷纟寅祚等主张拥立潞王朱常芳，议未定，而马士英与江北四镇拥福王朱由崧至，是为弘光帝，弘光帝立，迁大器吏部左侍郎，吕大器受排挤益急，上表揭发马士英弄权误国之行迹，弘光帝以”和衷体国”答之，不久刘泽清入朝，马士英阴令其劾奏大器、雷纟寅祚心怀异图，迫使吕大器乞休离位，吕大器乃写就监国告庙文书送交内阁，以表明自己毫无他图的心迹，马士英怀忿不已，又阴令太常卿李沾攻击大器，弘光帝怒遂撤大器一切职务，又命令法司逮办，当时因蜀地尽失而未执行。
弘光元年，明宗室唐王朱聿键在福州即位，是为隆武帝，召吕大器为兵部尚书兼东阁大学士，次年隆武帝汀州失守被掳绝食而死，吕大器奔广东与丁魁楚等拥立永明王监国，永明王乃令吕大器以原官兼掌兵部事，之后进少傅，尽督西南诸军，吕大器鞠躬尽瘁尽忠南明，顺治六年，吕大器病逝于贵州都匀，谥“文肃”，归葬四川遂宁磨溪，后迁葬遂宁城北嘉禾桥。